Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms