Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRATP43155 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms