Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGP37231 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGP37231 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGP37231 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGP37231 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGP37231 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGP37231 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGP37231 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGP37231 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGP37231 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGP37231 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGP37231 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGP37231 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGP37231 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGP37231 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGP37231 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGP37231 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGP37231 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGP37231 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGP37231 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGP37231 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGP37231 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGP37231 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGP37231 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGP37231 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGP37231 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGP37231 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGP37231 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGP37231 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGP37231 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGP37231 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGP37231 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGP37231 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGP37231 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGP37231 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGP37231 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGP37231 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGP37231 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGP37231 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGP37231 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGP37231 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGP37231 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGP37231 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGP37231 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGP37231 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGP37231 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGP37231 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGP37231 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGP37231 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms