Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJC1P36383 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJC1P36383 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJC1P36383 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJC1P36383 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJC1P36383 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJC1P36383 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJC1P36383 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJC1P36383 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJC1P36383 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJC1P36383 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJC1P36383 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJC1P36383 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJC1P36383 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJC1P36383 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJC1P36383 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJC1P36383 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJC1P36383 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJC1P36383 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJC1P36383 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJC1P36383 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJC1P36383 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJC1P36383 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJC1P36383 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJC1P36383 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJC1P36383 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJC1P36383 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJC1P36383 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJC1P36383 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJC1P36383 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJC1P36383 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJC1P36383 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GJC1P36383 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GJC1P36383 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GJC1P36383 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJC1P36383 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJC1P36383 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJC1P36383 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJC1P36383 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJC1P36383 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJC1P36383 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJC1P36383 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJC1P36383 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GJC1P36383 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GJC1P36383 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GJC1P36383 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GJC1P36383 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GJC1P36383 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GJC1P36383 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJC1P36383 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJC1P36383 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJC1P36383 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJC1P36383 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJC1P36383 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJC1P36383 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJC1P36383 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJC1P36383 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJC1P36383 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJC1P36383 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJC1P36383 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJC1P36383 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJC1P36383 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJC1P36383 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJC1P36383 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJC1P36383 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJC1P36383 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJC1P36383 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GJC1P36383 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJC1P36383 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJC1P36383 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJC1P36383 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GJC1P36383 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJC1P36383 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJC1P36383 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GJC1P36383 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJC1P36383 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJC1P36383 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJC1P36383 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJC1P36383 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJC1P36383 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJC1P36383 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJC1P36383 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJC1P36383 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJC1P36383 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJC1P36383 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJC1P36383 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJC1P36383 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJC1P36383 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJC1P36383 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJC1P36383 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJC1P36383 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJC1P36383 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GJC1P36383 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJC1P36383 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJC1P36383 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJC1P36383 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJC1P36383 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJC1P36383 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJC1P36383 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJC1P36383 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms