Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASQ1P31415 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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CASQ1P31415 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
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CASQ1P31415 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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CASQ1P31415 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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