Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms