Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCP25054 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCP25054 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCP25054 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCP25054 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
APCP25054 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCP25054 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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APCP25054 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
APCP25054 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCP25054 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
APCP25054 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCP25054 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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APCP25054 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCP25054 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCP25054 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCP25054 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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APCP25054 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCP25054 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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APCP25054 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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APCP25054 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APCP25054 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APCP25054 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APCP25054 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APCP25054 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APCP25054 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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APCP25054 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APCP25054 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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APCP25054 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APCP25054 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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APCP25054 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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APCP25054 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APCP25054 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APCP25054 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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APCP25054 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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APCP25054 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APCP25054 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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APCP25054 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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APCP25054 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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APCP25054 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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APCP25054 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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APCP25054 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APCP25054 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APCP25054 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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APCP25054 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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APCP25054 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APCP25054 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APCP25054 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APCP25054 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APCP25054 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APCP25054 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCP25054 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCP25054 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCP25054 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCP25054 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCP25054 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCP25054 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCP25054 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCP25054 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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