Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms