Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRGP23470 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
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