Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD247P20963 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD247P20963 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD247P20963 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD247P20963 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CD247P20963 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD247P20963 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD247P20963 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CD247P20963 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD247P20963 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD247P20963 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms