Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms