Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
XBP1P17861 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XBP1P17861 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XBP1P17861 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XBP1P17861 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XBP1P17861 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XBP1P17861 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
XBP1P17861 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XBP1P17861 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XBP1P17861 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XBP1P17861 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XBP1P17861 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XBP1P17861 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XBP1P17861 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XBP1P17861 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XBP1P17861 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XBP1P17861 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XBP1P17861 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XBP1P17861 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
XBP1P17861 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
XBP1P17861 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
XBP1P17861 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
XBP1P17861 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
XBP1P17861 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
XBP1P17861 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
XBP1P17861 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
XBP1P17861 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
XBP1P17861 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
XBP1P17861 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
XBP1P17861 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
XBP1P17861 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
XBP1P17861 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
XBP1P17861 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
XBP1P17861 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
XBP1P17861 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
XBP1P17861 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
XBP1P17861 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
XBP1P17861 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
XBP1P17861 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
XBP1P17861 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
XBP1P17861 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
XBP1P17861 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
XBP1P17861 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
XBP1P17861 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XBP1P17861 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
XBP1P17861 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XBP1P17861 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XBP1P17861 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XBP1P17861 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
XBP1P17861 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XBP1P17861 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XBP1P17861 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XBP1P17861 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
XBP1P17861 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
XBP1P17861 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
XBP1P17861 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XBP1P17861 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XBP1P17861 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
XBP1P17861 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
XBP1P17861 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
XBP1P17861 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
XBP1P17861 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
XBP1P17861 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
XBP1P17861 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
XBP1P17861 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
XBP1P17861 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
XBP1P17861 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
XBP1P17861 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
XBP1P17861 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XBP1P17861 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XBP1P17861 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XBP1P17861 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
XBP1P17861 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XBP1P17861 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XBP1P17861 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XBP1P17861 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
XBP1P17861 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
XBP1P17861 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
XBP1P17861 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
XBP1P17861 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XBP1P17861 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
XBP1P17861 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XBP1P17861 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XBP1P17861 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XBP1P17861 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
XBP1P17861 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XBP1P17861 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XBP1P17861 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
XBP1P17861 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XBP1P17861 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XBP1P17861 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XBP1P17861 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XBP1P17861 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XBP1P17861 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XBP1P17861 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XBP1P17861 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XBP1P17861 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XBP1P17861 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XBP1P17861 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XBP1P17861 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms