Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 DEFT1P-201ENST00000453425 496 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 AC092964.1-201ENST00000623304 1399 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 LINC02349-201ENST00000561386 963 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms