Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms