Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH1P12830 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH1P12830 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH1P12830 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH1P12830 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH1P12830 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH1P12830 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH1P12830 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH1P12830 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH1P12830 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH1P12830 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH1P12830 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH1P12830 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH1P12830 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH1P12830 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH1P12830 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH1P12830 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH1P12830 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH1P12830 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH1P12830 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH1P12830 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH1P12830 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH1P12830 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH1P12830 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH1P12830 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH1P12830 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH1P12830 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH1P12830 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH1P12830 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH1P12830 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH1P12830 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH1P12830 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH1P12830 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH1P12830 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH1P12830 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH1P12830 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH1P12830 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH1P12830 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH1P12830 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH1P12830 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH1P12830 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH1P12830 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH1P12830 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH1P12830 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH1P12830 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH1P12830 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH1P12830 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH1P12830 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH1P12830 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH1P12830 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH1P12830 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH1P12830 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH1P12830 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH1P12830 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH1P12830 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH1P12830 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH1P12830 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH1P12830 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH1P12830 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH1P12830 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH1P12830 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH1P12830 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH1P12830 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH1P12830 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH1P12830 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH1P12830 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms