Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms