Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SERPINA1P01009 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINA1P01009 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms