Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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C6orf47O95873 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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C6orf47O95873 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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C6orf47O95873 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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C6orf47O95873 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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