Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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