Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNMO15061 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNMO15061 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNMO15061 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNMO15061 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNMO15061 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNMO15061 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNMO15061 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNMO15061 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNMO15061 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNMO15061 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNMO15061 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNMO15061 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNMO15061 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNMO15061 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNMO15061 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNMO15061 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNMO15061 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNMO15061 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNMO15061 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNMO15061 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNMO15061 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNMO15061 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNMO15061 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNMO15061 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYNMO15061 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYNMO15061 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYNMO15061 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYNMO15061 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYNMO15061 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYNMO15061 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYNMO15061 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYNMO15061 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYNMO15061 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYNMO15061 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYNMO15061 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNMO15061 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNMO15061 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNMO15061 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNMO15061 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNMO15061 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNMO15061 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNMO15061 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNMO15061 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNMO15061 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNMO15061 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNMO15061 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNMO15061 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNMO15061 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNMO15061 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNMO15061 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNMO15061 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNMO15061 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNMO15061 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNMO15061 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNMO15061 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNMO15061 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNMO15061 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNMO15061 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNMO15061 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNMO15061 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNMO15061 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNMO15061 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNMO15061 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNMO15061 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNMO15061 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNMO15061 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNMO15061 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNMO15061 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNMO15061 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNMO15061 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNMO15061 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNMO15061 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNMO15061 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNMO15061 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNMO15061 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNMO15061 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNMO15061 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNMO15061 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNMO15061 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNMO15061 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNMO15061 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNMO15061 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNMO15061 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNMO15061 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNMO15061 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNMO15061 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNMO15061 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNMO15061 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNMO15061 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNMO15061 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNMO15061 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNMO15061 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNMO15061 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNMO15061 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNMO15061 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNMO15061 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNMO15061 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNMO15061 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNMO15061 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms