Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN8O00124 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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