Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8-MDP1E9PL57 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms