Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
B4DXG7 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
B4DXG7 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
B4DXG7 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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