Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms