Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms