Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms