Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms