Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms