Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms