Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD54L2Q9Y4B4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms