Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TPRKBQ9Y3C4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TPRKBQ9Y3C4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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TPRKBQ9Y3C4 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TPRKBQ9Y3C4 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TPRKBQ9Y3C4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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TPRKBQ9Y3C4 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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