Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFR3BQ9Y2G0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFR3BQ9Y2G0 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms