Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
USP25Q9UHP3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms