Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms