Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX3Q9UBR4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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