Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms