Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
REREQ9P2R6 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms