Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9Q9P2J2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9Q9P2J2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9Q9P2J2 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9Q9P2J2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9Q9P2J2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9Q9P2J2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9Q9P2J2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9Q9P2J2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9Q9P2J2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9Q9P2J2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9Q9P2J2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9Q9P2J2 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9Q9P2J2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9Q9P2J2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9Q9P2J2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9Q9P2J2 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9Q9P2J2 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9Q9P2J2 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9Q9P2J2 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9Q9P2J2 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9Q9P2J2 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9Q9P2J2 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9Q9P2J2 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9Q9P2J2 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9Q9P2J2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9Q9P2J2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9Q9P2J2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9Q9P2J2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9Q9P2J2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9Q9P2J2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9Q9P2J2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9Q9P2J2 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9Q9P2J2 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9Q9P2J2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9Q9P2J2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
IGSF9Q9P2J2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
IGSF9Q9P2J2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms