Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.6 ms