Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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