Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYP4F12Q9HCS2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYP4F12Q9HCS2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYP4F12Q9HCS2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYP4F12Q9HCS2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYP4F12Q9HCS2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYP4F12Q9HCS2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYP4F12Q9HCS2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYP4F12Q9HCS2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYP4F12Q9HCS2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F12Q9HCS2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F12Q9HCS2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F12Q9HCS2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F12Q9HCS2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F12Q9HCS2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F12Q9HCS2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F12Q9HCS2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F12Q9HCS2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F12Q9HCS2 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F12Q9HCS2 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F12Q9HCS2 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F12Q9HCS2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F12Q9HCS2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F12Q9HCS2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F12Q9HCS2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms