Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms