Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms