Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB11FIP5Q9BXF6 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms