Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms