Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS5

TRMT61B, tRNA (adenine(58)-N(1))-methyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT61BQ9BVS5 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRMT61BQ9BVS5 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms