Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVM4

GGACT, Gamma-glutamylaminecyclotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGACTQ9BVM4 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GGACTQ9BVM4 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms