Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms