Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms