Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SGIP1Q9BQI5 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms